A farkátlan DNS-tartalmú bakteriofágokat nem lehetett kimutatni szokásos módszerekkel - de a tudósok most úgy gondolják, hogy ők uralják a világ óceánjait.
Minden vízcsepp, amely nem túl mély a tenger felszínétől, körülbelül 10 millió vírust tartalmaz. Aligha meglepő, hogy a biológusok folyamatosan fedeznek fel újakat, bár egy teljesen új csoport felfedezése még mindig nagyon ritka. Úgy tűnik, hogy a szokásos technikák egyszerűen nem tették lehetővé észrevételüket, bár az ilyen vírusok rendkívül soknak bizonyultak - talán nemcsak az óceánban vannak elterjedtek és egyszerűen elkerülik a tudósokat.
Martin Polz a Massachusettsi Technológiai Intézetből és munkatársai megvizsgálták az Atlanti-óceán észak-amerikai partvidékéről vett vízmintákat. Kettős szálú DNS-t tartalmazó vírusokat kerestek - ezek a vírusok rendkívül elterjedtek, ideértve a herpeszet és a T4 bakteriofágot (Caudovirales), akik az iskolában mindenki számára ismertek. A Vibrionaceae tengeri baktériumok tenyészeteit megfertőzve a tudósok 200 különböző DNS-vírust fedeztek fel, amelyek közül 18-at az új Autolykiviridae rendnek tulajdonítottak. Erről a Nature folyóiratban megjelent cikkben írnak.
A csoport neve a görög mitológia hősének, az Autolycusnak a ravasz tolvajra utal, akit ugyanolyan nehéz elkapni, mint ezeket a vírusokat. "A leggyakoribb vírusok a Földön a kettős szálú DNS-t tartalmazó baktériumokkal fertőző vírusok" - írják Poltz és társszerzői. „Ugyanakkor a farokvírusokkal rendelkező Caudovirales, amelyek az adatbázisokban és a növénygyűjteményekben dominálnak, nem képviselik a környezetben való jelenlétüket. Valójában a vízmintákban farkátlan vírusok dominálnak."
Autolykiviridae / MIT Phages fertőzött baktériumsejtek, Kauffman et al., 2018.
Az Autolykiviridae "farkátlan" bakteriofágokat kis genomméret jellemzi - csak körülbelül 10 ezer bázis, 4-5-szer kevesebb, mint a "farkú" rokonoknál. Szintén szokatlan volt a baktériumsejtek fertőzésének és elpusztításának képessége. Ha a kísérletekben a szokásos fágok rendszerint egy adott vibriofajt érintettek, akkor ezek átlagosan négy fertőződtek, és észrevehetően magasabb sejthalálhoz vezettek. "Azt találták, hogy felelősek a baktériumhalálozás 40% -áért, bár a mintában szereplő összes vírus kb. 10% -áért felelősek" - magyarázza a munka egyik szerzője.
Különböző fajok vibrio baktériumai a diagram kerülete mentén helyezkednek el; velük fertőző vírusok köre társul: kék - "farkú" bakteriofágok, narancs - "farok nélküli" Autolykiviridae / MIT, Kauffman et al., 2018.
Ezek az adatok azt mutatják, hogy az új Autolykiviridae csoport nagy szerepet játszik a baktériumpopulációk szabályozásában és a bioszféra egészében. A tudósok biztosak abban, hogy technikájuk segít olyan vírusok megtalálásában, amelyek korábban elkerültek a talajban és esetleg az emberi bélben kimutatást. Hasonló genetikai szekvenciák valóban megtalálhatók a baktériumok genomjában az emberi mikroflórában.
Promóciós videó:
Szergej Vasziljev