A tudósok a sertésgenomban egyedülálló rövid ismétlések családját fedezték fel, amelyek evolúciós hasonlóságot mutatnak a főemlősök hasonló ismétlődéseivel.
A Jilin Egyetem (Changchun, Kína) és az Agrártudományi Akadémia (Heilongjiang, Kína) tudósai részt vettek a projektben a Firefly BioWorks Corporation (USA) közreműködésével.
A PRE-1 (sertésismétlő elem, szó szerint - "disznóismétlő elem") szerkezetének és eredetének elemzése után arra a következtetésre jutottak, hogy a főemlősök legközelebbi rokonai az egykori szuperkontinens Laurasiaban disznók lehetnek. A kutatási előnyomatot 2015. augusztus 31-én tették közzé a bioRxiv szerveren.
A vizsgált CDP (rövid diszpergált ismétlés) PRE-1 az intergenikus régióban helyezkedik el, körülbelül 686 ~ 985 bázispár az inzulin növekedési faktort megkötő fehérjét (IGFBP7) kódoló gén megkezdése előtt. Az ismétlődő 299 bázispár PRE-1 szekvenciát 40 különböző főemlős Alu ismétléssel hasonlítottuk össze, és szignifikáns hasonlóságot találtak mind magukban a szekvenciákban, mind pedig a kromoszómák közötti megismétlődésük mintázatában.
Az RNS megjósolt másodlagos szerkezete az Alu-ismétlésekhez hasonló modellbe hajtogatott PRE-1-et ismétli. Végül a PRE-1 és az Alu eredete az úgynevezett 7SL RNS-ből (szignálfelismerő RNS) evolúciós hasonlóságukra utalt, és a disznókat a főleg főemlősöket tartalmazó családhoz rendelte.
Korábban a filogenetikai fák építéséhez a tudósok csak a gének hasonlóságaira és különbségeire támaszkodtak, figyelmen kívül hagyva azt a tényt, hogy az evolúció során az egész genom változáson ment keresztül, beleértve azokat az elemeit is, amelyek nem kódolják a fehérjéket vagy az RNS-t, és amelyek jelentése a tudósok számára még mindig nagyrészt nem világos.
Promóciós videó:
Ez az intergenikus elemek elemzésének integrált megközelítésén alapuló tanulmány a szerzők szerint "nagyon meggyőző" tényeket közöl, amelyekből evolúciós következtetéseket lehet levonni. Ezen eredmények szerint a fajok eltérésének becsült ideje 65-ről 80-100 millió évvel ezelőtt eltolódik.